英文名称: 3H-Indolium, 2-[3-[1-[3-[[[bis(1-methylethyl)amino](2-cyanoethoxy)phosphino]oxy]propyl]-1,3-dihydro-3,3-dimethyl-股票配资服务中心2H-indol-2-ylidene]-1-propen-1-yl]-1-[3-[(4-methoxyphenyl)diphenylmethoxy]propyl]-3,3-dimethyl-, chloride (1:1)
中文名称: CY3-亚磷酰胺(齐岳生物)
Cyanine3磷酰胺的化学特性与应用
Cyanine3(Cy3)磷酰胺是一类在分子生物学和核酸化学中广泛使用的荧光标记试剂。其主要用途是将荧光团通过共价键连接到寡核苷酸或其他生物大分子,从而实现高灵敏度的检测和成像。Cyanine3属于单链或共轭链染料,其吸收光谱约在550 nm,发射光谱在570 nm左右,具有较高的荧光量子产率和良好的光稳定性。
化学结构与反应特性
Cyanine3磷酰胺的核心结构由两个杂环染料通过共轭链连接而成,其中含有活性磷酰胺基团(phosphoramidite),这一基团可在固相寡核苷酸合成(Solid-Phase Oligonucleotide Synthesis, SPOS)中通过磷酰胺化学反应高效接入核苷酸链。该化学反应通常在无水有机溶剂(如乙腈)中进行,需在碱性条件下启动,并伴随保护基团的选择性去保护步骤,以保证合成产物的结构完整性。
展开剩余70%磷酰胺化反应具有以下特点:
选择性高:磷酰胺与核酸的5’羟基或内部修饰位点特异性结合,减少非特异性副反应。 反应效率高:在常规固相合成条件下,连接效率可达95%以上,利于高产率的荧光标记核酸制备。 兼容性好:Cyanine3磷酰胺可以与多种保护基团和其他修饰试剂共用,适合复杂核酸设计,如引入荧光探针、配体或其他功能基团。应用领域
Cyanine3标记的寡核苷酸在分子生物学实验中用途广泛,主要包括以下几类:
荧光原位杂交(FISH) FISH技术依赖荧光标记寡核苷酸与靶序列的特异性杂交。Cy3作为荧光团,提供高灵敏度的信号,可用于细胞和组织切片中靶基因或染色体的定位。其发射波长适合多色成像,与其他荧光染料如FAM、Cy5组合时,能够实现多通道检测。 实时定量PCR(qPCR) 在qPCR检测中,Cyanine3标记的引物或探针可实时监控扩增产物的积累。由于Cy3具有较高的量子效率和稳定的荧光信号,它能够提供可靠的定量信息,有助于基因表达分析、拷贝数检测以及病原体检测等实验。 分子成像与荧光显微镜 Cyanine3标记的核酸或蛋白质可用于细胞内成像实验。其光谱特性适合共聚焦显微镜和高通量成像系统,能够实现亚细胞水平的定位研究。此外,Cy3荧光信号的亮度和稳定性使其在多轮成像实验中保持可靠。 DNA微阵列技术 在芯片技术中,Cyanine3标记的探针可固定在固相支持物上,与样品DNA杂交后通过荧光扫描进行定量分析。这类应用对标记的稳定性和均一性要求较高,Cy3磷酰胺能够满足长期保存和高重复性的需求。储存与操作注意事项
Cyanine3磷酰胺为光敏性化合物,应避光保存,常温或低温干燥条件下可稳定保存数月。溶解时建议使用无水乙腈或二氯甲烷,避免水分接触以防水解失活。在固相合成中,注意操作环境干燥,并快速完成脱保护和洗脱步骤,以获得高纯度产物。
总结
Cyanine3磷酰胺是一类可靠的荧光标记试剂,通过其活性磷酰胺基团,可以方便地接入寡核苷酸或其他生物大分子,实现多种分子生物学实验需求。凭借其高荧光效率、良好光稳定性及化学反应兼容性,Cy3磷酰胺在FISH、qPCR、荧光成像以及DNA微阵列等领域中被广泛采用,为科学研究提供了高灵敏度的实验工具。
MF: C58H70ClN4O4P
MW: 953.65
CAS: 182873-76-3
Cyanine3 phosphoramidite
包装: 瓶装
适用范围:仅限科研实验使用
规格选择: 多种规格,包含50 mg、100 mg、250 mg、500 mg等
物理形态: 可根据需求提供固体、粉末或溶液形式
储存条件: 建议冷藏保存,以维持产品的稳定性和活性
推荐试剂: 荧光淬灭剂Tide Quencher 6WS胺 1006711-90-5 Maleimido-mono-amide-DOTA DOTA-Acrylamide,DOTA-ACA,DOTA-丙烯酰胺 FITC-DBCO,2054339-00-1 2713-54-4 α-D-Mannopyranosyl Fluo 糖化学 Cyanine7.5 dimethyl 2213445-35-1,BDP 630/650-X-NHS
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